ビッグニュース: IBM が 3 つの抗がん AI プロジェクトをオープンソース化しました。

最近、IBM は、がん治療の課題を克服することを目的とした 3 つの AI プロジェクトをオープンソース コミュニティにリリースしました。 PaccMann プロジェクトは、今月下旬にスイスで開催される第 18 回ヨーロッパ計算生物学会議 (ECCB) と第 27 回分子生物学インテリジェントシステム会議 (ISMB) で詳細に発表される予定です。

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2018年には、世界中で960万人ががんで亡くなり、同年に1,800万人以上の新たながん症例が報告されました。 IBM の計算システム生物学グループの研究者は、腫瘍の構成に関する理解を深めることに重点を置き、これらのがんを引き起こす主な要因と分子メカニズムを迅速に理解できるようにするために、AI と機械学習に基づくアプローチに取り組み始めました。

遺伝、汚染、喫煙、食事による素因はすべて、がんを引き起こす可能性のある要因と考えられていますが、まだ調査が必要な要因は数多くあります。IBMは次のように述べています。「私たちの目標は、がんに対する理解を深め、いつの日か産業界や学界に新たな治療の方向性や知識を提供できるようにすることです。」

今回IBMがオープンソース化した3つのプロジェクトは以下のとおりです。

1. パックマン

PaccMann プロジェクトは、注意ベースのマルチモーダル ニューラル ネットワークを使用して抗がん化合物の感受性を予測することを目指しています。このプロジェクトでは、ML アルゴリズムが化合物を自動的に分析し、がん株と戦う可能性が最も高い化合物を予測します。

このアルゴリズムは、遺伝子発現データと化合物の分子構造を使用します。 IBMは、潜在的な抗がん化合物を早期に特定することで医薬品開発コストを削減できる可能性があると述べている。現在、がん治療薬1つを開発するには数百万ドルの費用がかかり、この高額な研究開発費こそが、新薬や治療法の開発のペースを妨げているのです。 (アドレス: https://www.zurich.ibm.com/paccmann/)

2. 交流する

INtERAcT は、研究者が大量の科学文献から貴重なデータを自動的に抽出するのに役立ちます。がん研究の分野では毎年約 17,000 件の出版物が発表されており、研究者がそれらをすべて 1 つずつ読むことは不可能です。INtERAcT は現在、がんを含むさまざまな疾患における生物学的プロセスの混乱の要因として特定されている研究分野であるタンパク質間相互作用に関連するデータを抽出するためにテストされています。 (アドレス: https://www.zurich.ibm.com/interact/)

3.ピムクル

3 番目のプロジェクトである PIMKL は、分子相互作用に関する現在の理解を記述したデータセットを使用して、がんの進行と患者の再発の可能性を予測するアルゴリズムです。これは、患者の分類に重要な分子経路を特定し、医療専門家に治療計画をパーソナライズおよび調整するためのソリューションを提供できる、マルチカーネル学習の一種です。 (アドレス: https://www.zurich.ibm.com/pimkl/)

これら 3 つのプロジェクトはすべてオープンソース化されています。PaccMann と INtERAcT のオープンソース コードは、それぞれの公式 Web サイトで参照できます。PIMKL は IBM Cloud にデプロイされており、そのソース コードも公開されています。

OpenSourceTop によってコンパイル

プロジェクトアドレス: https://www.techzine.be/nieuws/41092/ibm-maakt-drie-ai-projecten-gericht-op-kankeronderzoek-opensource.html